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Enregistrement W2138620457 · doi:10.1016/j.jviromet.2013.07.006

Development of a Rift Valley fever real-time RT-PCR assay that can detect all three genome segments

2013· article· en· W2138620457 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Virological Methods · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Vectors
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesAgricultural Research ServiceScience and Technology DirectorateU.S. Department of StateU.S. Department of AgricultureU.S. Department of Homeland Security
Mots-clésRift Valley feverBiologyVirologyOutbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Outbreaks of Rift Valley fever in Kenya, Madagascar, Mauritania, and South Africa had devastating effects on livestock and human health. In addition, this disease is a food security issue for endemic countries. There is growing concern for the potential introduction of RVF into non-endemic countries. A number of single-gene target amplification assays have been developed for the rapid detection of RVF viral RNA. This paper describes the development of an improved amplification assay that includes two confirmatory target RNA segments (L and M) and a third target gene, NSs, which is deleted in the Clone 13 commercial vaccine and other candidate vaccines. The assay also contains an exogenous RNA control added during the PCR setup for detection of amplification inhibitors. The assay was evaluated initially with samples from experimentally infected animals, after which clinical veterinary and human samples from endemic countries were tested for further evaluation. The assay has a sensitivity range of 66.7-100% and a specificity of 92.0-100% depending on the comparison. The assay has an overall sensitivity of 92.5%, specificity of 95% and a positive predictive value of 98.7%. The single-tube assay provides confirmation of the presence of RVFV RNA for improved confidence in diagnostic results and a "differentiate infected from vaccinated animals" (DIVA)--compatible marker for RVFV NSs--deleted vaccines, which is useful for RVF endemic countries, but especially important in non-endemic countries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,937
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle