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Enregistrement W2138672668 · doi:10.1161/circgenetics.110.936955

Novel Nonmajor Histocompatibility Complex–Linked Loci From Mouse Chromosome 17 Confer Susceptibility to Viral-Mediated Chronic Autoimmune Myocarditis

2010· article· en· W2138672668 sur OpenAlexfundno aff
Maya C. Poffenberger, Iryna Shanina, Connie Aw, Nahida El Wharry, Nadine Straka, Dianne Fang, Annie E. Baskin-Hill, Sabrina H. Spiezio, Joseph H. Nadeau, Marc S. Horwitz

Notice bibliographique

RevueCirculation Cardiovascular Genetics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Immunology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyGeneticsLocus (genetics)CongenicMajor histocompatibility complexChromosomeGeneGenetic predispositionChromosome 17 (human)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Development of viral-induced chronic myocarditis is thought to involve both environmental and genetic factors. However, to date, no susceptibility genes have been identified. METHODS AND RESULTS: We sought to identify loci that confer susceptibility to viral-induced chronic myocarditis with the use of chromosome substitution strain mice that are composed of 1 chromosome from the disease susceptible A/J strain on an otherwise resistant C57BL/6 background. By this method, we identified chromosome 17 to confer susceptibility. To further isolate the region of susceptibility, 8 strains of mice congenic for different portions of chromosome 17 were generated. Characterization of these strains identified at least 4 susceptibility loci on the chromosome. Three of these loci are located in the proximal 22.8 cM, whereas the fourth locus is located in the portion of the chromosome distal to 34.3 cM. CONCLUSIONS: We have identified 4 loci that confer susceptibility of viral-induced chronic myocarditis. Of these loci, 3 were distinct from the major histocompatibility complex locus and thus represent novel susceptibility loci. The close proximately of the 2 novel loci with susceptibility loci for other autoimmune diseases such as type 1 diabetes and chronic experimental autoimmune thyroiditis suggests the presence of global autoimmune susceptibility genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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