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Enregistrement W2138694026 · doi:10.1309/vp4w-5c55-7m09-6tx3

Comparison of HER2/<i>neu</i>Status Assessed by Quantitative Polymerase Chain Reaction and Immunohistochemistry

2001· article· en· W2138694026 sur OpenAlex
Frances P. O’Malley, Robert Parkes, Eleanor Latta, Suzanna Tjan, Tanya Zadro, Rosemary Mueller, Nona Arneson, Martin E. Blackstein, Irene L. Andrulis

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Clinical Pathology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunohistochemistryConcordancePolymerase chain reactionMedicinePathologyReal-time polymerase chain reactionBiologyMolecular biologyInternal medicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We prospectively evaluated a series of 254 breast cancers by quantitative polymerase chain reaction (PCR) and immunohistochemistry using 3 antibodies: HercepTest, CB11, and TAB250. DNA was extracted from a 10-micron tumor section for PCR, and 4-micron serial sections were taken from the same block for immunohistochemistry. The immunohistochemical results were scored using a semiquantitative immunohistochemical system. A positive tumor by immunohistochemistry had a score of 5 or more. The manufacturer's recommended scoring system was used for the HercepTest. Tumors were positive for gene amplification if the ratio of the HER2/neu gene to control gene after normalization was 2 or more. Of 254 cases, 61 showed gene amplification. For immunohistochemistry, 23% of tumors were positive with CB11, 27% with TAB250, and 37% with the HercepTest. Results for each antibody were compared with PCR results. The overall concordance for the HercepTest was 82%, which was significantly lower than that for CB11 (88%) or TAB250 (87%). The specificity for the HercepTest was 80% compared with 90% for TAB250 and 93% for CB11, while the positive predictive value for the HercepTest was 57% compared with 71% and 76% for TAB250 and CB11, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,404
Score d'incertitude au seuil0,600

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,545
Écart entre enseignants0,444 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle