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Enregistrement W2138829076 · doi:10.1002/humu.20215

<i>SALL4</i>mutations in Okihiro syndrome (Duane-radial ray syndrome), acro-renal-ocular syndrome, and related disorders

2005· article· en· W2138829076 sur OpenAlexaff
Jürgen Kohlhase, David Chitayat, Dieter Kotzot, Serdar Ceylaner, Ursula G. Froster, Sigrun Fuchs, Tara Montgomery, Bernd Rösler

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenMount Sinai HospitalSickKids Foundation
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneticsExonZinc fingerHaploinsufficiencyNonsense mutationGeneLocus (genetics)Stop codonPhenotypeMissense mutationTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Okihiro/Duane-radial ray syndrome (DRRS) is an autosomal dominant condition characterized by radial ray defects and Duane anomaly (a form of strabismus). Other abnormalities reported in this condition are anal, renal, cardiac, ear, and foot malformations, and hearing loss. The disease is the result of a mutation in the SALL4 gene, a human gene related to the developmental regulator spalt (sal) of Drosophila melanogaster. SALL4 mutations may also cause acro-renal-ocular syndrome (AROS), which differs from DRRS by the presence of structural eye anomalies, and phenotypes similar to thalidomide embryopathy and Holt-Oram syndrome (HOS). The SALL4 gene product is a zinc finger protein that is thought to act as a transcription factor. It contains three highly conserved C2H2 double zinc finger domains, which are evenly distributed. A single C2H2 motif is attached to the second domain, and at the amino terminus SALL4 contains a C2HC motif. Seventeen of the 22 SALL4 mutations known to date (five of which are presented here for the first time) are located in exon 2, and five are located in exon 3. These are nonsense mutations, short duplications, and short deletions. All of the mutations lead to preterminal stop codons and are thought to cause the phenotype via haploinsufficiency. This assumption is supported by the detection of six larger deletions involving the whole gene or single exons. This article summarizes the current knowledge about SALL4 defects and associated syndromes, and describes the clinical distinctions with similar phenotypes caused by other gene defects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations123
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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