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Enregistrement W2138897150 · doi:10.1093/clinchem/46.7.1005

Enzyme-based Diagnosis of Classical Late Infantile Neuronal Ceroid Lipofuscinosis: Comparison of Tripeptidyl Peptidase I and Pepstatin-insensitive Protease Assays

2000· article· en· W2138897150 sur OpenAlexfundno aff
István Sohár, Li Lin, Peter Lobel

Notice bibliographique

RevueClinical Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMcGill UniversityNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institutes of HealthSchool of Medicine, Indiana UniversityBatten Disease Support and Research Association
Mots-clésPepstatinEnzymeProteaseBiochemistryNeuronal ceroid lipofuscinosisChemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The neuronal ceroid lipofuscinoses (NCLs) are a group of inherited neurodegenerative diseases that include infantile NCL (INCL; OMIM 256730, where the defective gene is CLN1), classical late infantile NCL (LINCL; OMIM 204500, where the defective gene is CLN2), two variant late infantile NCLs (OMIM 256731, where the defective gene is CLN5; and OMIM 601780, where the defective gene is CLN6), juvenile NCL (JNCL; OMIM 204200; defective gene, CLN3), a juvenile onset epilepsy with progressive mental retardation (EPMR; OMIM 600143; defective gene, CLN8), and adult NCL (Kufs disease; OMIM 204300; defective gene, CLN4) [reviewed in Ref. (1)]. Patients experience a progressive and profound loss of neurons in the central nervous system that generally is associated with increasingly severe epileptic seizures, visual failure, ataxia, mental deterioration, and early death. At the cellular level, the NCLs are characterized by accumulation of autofluorescent storage material in lysosome-like organelles in neurons and other cell types. Different forms of NCLs have traditionally been classified on the basis of age of onset of symptoms and cellular morphology and, more recently, by molecular criteria. Molecular analysis has revealed that different mutations in a given NCL gene can produce distinct clinical presentations [e.g., CLN2 deficiencies can lead to late infantile as well as juvenile onset disease (2), CLN1 deficiencies to infantile as well as late infantile and juvenile onset disease (3), and CLN3 deficiencies to juvenile as well as delayed onset disease (4)(5)]. Because of the existence of multiple NCL disease genes that can have overlapping clinical manifestations, simple clinical assays for NCL classification are useful before proceeding to DNA-based analysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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