Duplication of Teichoic Acid Biosynthetic Genes in <i>Staphylococcus aureus</i> Leads to Functionally Redundant Poly(Ribitol Phosphate) Polymerases
Notice bibliographique
Résumé
Wall teichoic acids are anionic phosphate-rich polymers that are part of the complex meshwork of carbohydrates that make up the gram-positive cell wall. These polymers are essential to the proper rod-shaped morphology of Bacillus subtilis and have been shown to be an important virulence determinant in the nosocomial opportunistic pathogen Staphylococcus aureus. Together, sequence-based studies, in vitro experiments with biosynthetic proteins, and analyses of the chemical structure of wall teichoic acid have begun to shed considerable light on our understanding of the biogenesis of this polymer. Nevertheless, some paradoxes remain unresolved. One of these involves a putative duplication of genes linked to CDP-ribitol synthesis (tarI'J' and tarIJ) as well as poly(ribitol phosphate) polymerization (tarK and tarL) in S. aureus. In the work reported here, we performed careful studies of the dispensability of each gene and discovered a functional redundancy in the duplicated gene clusters. We were able to create mutants in either of the putative ribitol phosphate polymerases (encoded by tarK and tarL) without affecting teichoic acid levels in the S. aureus cell wall. Although genes linked to CDP-ribitol synthesis are also duplicated, a null mutant in only one of these (tarI'J') could be obtained, while tarIJ remained essential. Suppression analysis of the tarIJ null mutant indicated that the mechanism of dysfunction in tarI'J' is due to poor translation of the TarJ' enzyme, which catalyzes the rate-limiting step in CDP-ribitol formation. This work provides new insights into understanding the complex synthetic steps of the ribitol phosphate polymer in S. aureus and has implications on specifically targeting enzymes involved in polymer biosynthesis for antimicrobial design.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».