Protein expression by planktonic and biofilm cells of<i>Streptococcus mutans</i>
Notice bibliographique
Résumé
Streptococcus mutans, a major causal agent of dental caries, functions in nature as a component of a biofilm on teeth (dental plaque) and yet very little information is available on the physiology of the organism in such surface-associated communities. As a consequence, we undertook to examine the synthesis of proteins by planktonic and biofilm cells growing in a biofilm chemostat at pH 7.5 at a dilution rate of 0.1 h(-1) (mean generation time=7 h). Cells were incubated with (14)C-labelled amino acids, the proteins extracted and separated by two-dimensional electrophoresis followed by autoradiography and computer-assisted image analysis. Of 694 proteins analysed, 57 proteins were enhanced 1.3-fold or greater in biofilm cells compared to planktonic cells with 13 only expressed in sessile cells. Diminished protein expression was observed with 78 proteins, nine of which were not expressed in biofilm cells. The identification of enhanced and diminished proteins by mass spectrometry and computer-assisted protein sequence analysis revealed that, in general, glycolytic enzymes involved in acid formation were repressed in biofilm cells, while biosynthetic processes were enhanced. The results show that biofilm cells possess novel proteins, of as yet unknown function, that are not present in planktonic cells.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».