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Enregistrement W2139032699 · doi:10.1128/jb.182.24.6958-6963.2000

<i>N</i> -Acetyl-1- <scp>d</scp> - <i>myo</i> -Inosityl-2-Amino-2-Deoxy-α- <scp>d</scp> -Glucopyranoside Deacetylase (MshB) Is a Key Enzyme in Mycothiol Biosynthesis

2000· article· en· W2139032699 sur OpenAlexafffund
Gerald L. Newton, Yossef Av‐Gay, Robert C. Fahey

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesFogarty International CenterNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesUniversity of British ColumbiaNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismBritish Columbia Lung AssociationNational Science Foundation
Mots-clésMycobacterium smegmatisBiochemistryAmidaseBiologyBiosynthesisAcetyltransferaseAcetylationEnzymeMycobacterium tuberculosisGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycothiol is a novel thiol produced only by actinomycetes and is the major low-molecular-weight thiol in mycobacteria. Mycothiol was previously shown to be synthesized from 1-D-myo-inosityl-2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside by ligation with cysteine followed by acetylation. A novel mycothiol-dependent detoxification enzyme, mycothiol conjugate amidase, was recently identified in Mycobacterium smegmatis and shown to have a homolog, Rv1082, in Mycobacterium tuberculosis. In the present study we found that a protein encoded by the M. tuberculosis open reading frame Rv1170, a homolog of Rv1082, possesses weak mycothiol conjugate amidase activity but shows substantial deacetylation activity with 1-D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside (GlcNAc-Ins), a hypothetical mycothiol biosynthetic precursor. The availability of this protein enabled us to develop an assay for GlcNAc-Ins, which was used to demonstrate that GlcNAc-Ins is present in M. smegmatis at a level about twice that of mycothiol. It was shown that GlcNAc-Ins is absent in mycothiol-deficient mutant strain 49 of M. smegmatis and that this strain can concentrate GlcNAc-Ins from the medium and convert it to mycothiol. This demonstrates that GlcNAc-Ins is a key intermediate in the pathway of mycothiol biosynthesis. Assignment of Rv1170 as the gene coding the deacetylase in the M. tuberculosis genome represents the first identification of a gene of the mycothiol biosynthesis pathway. The presence of a large cellular pool of substrate for this enzyme suggests that it may be important in regulating mycothiol biosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations106
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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