MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2139103604 · doi:10.1099/ijs.0.63195-0

Roseicyclus mahoneyensis gen. nov., sp. nov., an aerobic phototrophic bacterium isolated from a meromictic lake

2005· article· en· W2139103604 sur OpenAlexafffundabout
Christopher Rathgeber, Natalia Yurkova, Erko Stackebrandt, Peter Schümann, J. Thomas Beatty, Vladimir Yurkov

Notice bibliographique

RevueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPhototrophBiologyAlphaproteobacteriaBacteriaBotany16S ribosomal RNABacteriochlorophyllSalinityExtreme environmentHeterotrophMicrobiologyEcologyPhotosynthesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eight strains of Gram-negative bacteria able to form ring-like cells were isolated from Mahoney Lake, a meromictic lake in south-central British Columbia, Canada. All strains were pink-purple and contained bacteriochlorophyll a incorporated into the light-harvesting 1 and 2 and reaction-centre pigment-protein complexes. Growth did not occur anaerobically under illuminated conditions; these strains were obligately aerobic, prompting their designation as members of the aerobic phototrophic bacteria. Physiological characterization revealed that these isolates share a similar tolerance to high levels of salinity and pH, as would be expected of bacteria from a highly saline lake; however, the strains exhibited marked differences in their ability to utilize organic substrates for aerobic heterotrophic growth. 16S rRNA sequence analysis showed that the strains are closely related to members of the non-phototrophic genera Octadecabacter (92.0-92.9%) and Ketogulonicigenium (92.2-92.6%), as well as to aerobic phototrophs of the genera Roseivivax (92.2-92.9%) and Roseovarius (91.7-92.4%) within the 'Alphaproteobacteria'. The DNA G+C content was 66.2 mol%. The unusual light-harvesting complex 2, the distinct morphological features and physiological traits of these strains as well as the phylogenetic data support the proposal of the novel genus and species Roseicyclus mahoneyensis gen. nov., sp. nov., with ML6(T) (=DSM 16097(T)=VKM B-2346(T)) as the type strain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,972
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2005
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueINTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGYMême sujetMicrobial Community Ecology and PhysiologyTravaux en français237 207