The Arabidopsis NPR1/NIM1 Protein Enhances the DNA Binding Activity of a Subgroup of the TGA Family of bZIP Transcription Factors
Notice bibliographique
Résumé
The Arabidopsis NPR1 gene is essential in activating systemic, inducible plant defense responses. To gain a better understanding of NPR1 function, we conducted a yeast two-hybrid screening procedure and identified a differential interaction between NPR1 and all known members of the Arabidopsis TGA family of basic leucine zipper transcription factors. In the electrophoretic mobility shift assay, NPR1 substantially increased the binding of TGA2 to its cognate promoter element (as-1) as well as to a positive salicylic acid-inducible element (LS7) and a negative element (LS5) in the promoter of the pathogenesis-related PR-1 gene. Proteins encoded by npr1 mutants interacted poorly with TGA2 and did not substantially increase TGA2 binding to the as-1, LS5, or LS7 elements, thus establishing a link between the loss of disease resistance and the loss of TGA2 interaction and NPR1-enhanced DNA binding. Coupled with observations that the DNA binding activity of TGA factors is deregulated in npr1 plants, the results suggest that NPR1-mediated DNA binding of TGA2 is critical for activation of defense genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».