Pleiotropic QTL on Chromosome 12q23-q24 Influences Triglyceride and High-Density Lipoprotein Cholesterol Levels: The HERITAGE Family Study
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
To determine whether a common quantitative trait locus (QTL) influences the variation of fasting triglyceride (TG) and high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C) levels, we used a bivariate multipoint linkage analysis with 654 polymorphic markers in 99 white and 101 black families. The phenotypes were investigated under two conditions: at baseline and after a 20-week exercise training intervention. A maximum genome-wide bivariate LOD score of 3.0 (p = 0.00010) was found on chromosome 12q23-q24, located within the IGF1 gene (insulin-like growth factor 1, at 107 cM) for TG and HDL-C at baseline in whites. This bivariate linkage peak is considerably higher than the univariate linkage results at the same chromosome location for either trait (for TG, LOD = 2.07, p = 0.00108; for HDL-C, LOD = 2.04, p = 0.00101). The genetic correlations between baseline TG and HDL-C levels were -0.14 for the residual and -0.33 for the QTL components. Moreover, association analysis showed that TG, HDL-C, and IGF1 are significantly associated (p = 0.04). In conclusion, these results suggest that a QTL on chromosome 12q23-q24 influences the variation of plasma TG and HDL-C levels. Further investigation should confirm whether IGF1 or another nearby gene is responsible for the concomitant variation in TG and HDL-C levels.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle