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Enregistrement W2139192206 · doi:10.5539/jfr.v4n1p88

Effect of a BlpC-Based Quorum-Sensing Induction Peptide on Bacteriocin Production in Streptococcus thermophilus

2014· article· en· W2139192206 sur OpenAlexvenueno aff
George A. Somkuti, John A. Renye

Notice bibliographique

RevueJournal of Food Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacteriocinStreptococcus thermophilusQuorum sensingMutantMicrobiologyBiologyChemistryAntimicrobialBiochemistryVirulenceGeneFermentationLactobacillus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacteriocin synthesis in some Streptococcus thermophilus strains is under the control of a complex blp locus but bacteriocin is produced only when a quorum-sensing regulatory mechanism is activated by the protein product of the blpC component. To demonstrate the regulatory effect of BlpC in S. thermophilus ST110 (NRRL-B59671), which naturally produces bacteriocin, the effect of the 30mer quorum-sensing induction peptide (QSIP) embedded in BlpC was tested in a knockout mutant in which the blpC gene was eliminated and was devoid of antimicrobial activity. Between concentrations of 30 and 250 ng/ml, the addition of synthetic QSIP to cultures at several points of the growth curve resulted in the accumulation of up to 3,200 units/ml of bacteriocin after 8 h of growth at 37 ºC. Addition of QSIP to the culture in late log phase (OD660 ? 1.0) when the medium pH is already 4.8 or lower, failed to trigger bacteriocin production. We used synthetic QSIP to survey its impact on 35 strains of S. thermophilus that do not display bacteriocin activity by agar diffusion assays. The addition of QSIP (250 ng/ml) to S. thermophilus cultures in the early or mid-log phase induced bacteriocin production in two strains that could be re-classified as bacteriocin producers. The results demonstrated the involvement of a quorum-sensing regulatory mechanism in bacteriocin synthesis in S. thermophilus ST110 and also demonstrated the utility of the 30 mer QSIP in discovering bacteriocins with potentially novel antimicrobial spectra by enhancing bacteriocin production in other strains of S. thermophilus that ordinarily display a bacteriocin-negative phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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