A tyrosine703serine polymorphism of CD109 defines the Gov platelet alloantigens
Notice bibliographique
Résumé
The biallelic platelet-specific Gov antigen system-implicated in refractoriness to platelet transfusion, neonatal alloimmune thrombocytopenia, and posttransfusion purpura-is carried by the glycosylphosphatidylinositol (GPI)-linked protein CD109. The recent identification of the human CD109 complementary DNA (cDNA) has allowed the molecular nature of the Gov alleles to be elucidated. By using reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) to amplify CD109 cDNAs from 6 phenotypically homozygous Gov(aa) and Gov(bb) individuals, we have determined that the Gov alleles differ by an A to C single nucleotide polymorphism (SNP) at position 2108 of the coding region, resulting in a Tyr/Ser substitution at CD109 amino acid 703. Allele-specific PCR sequence-specific primers (SSP), PCR-restriction fragment length polymorphism, and real-time PCR studies of 15 additional donors (5 Gov(aa), 5 Gov(bb), and 5 Gov(ab)) confirmed that this SNP correlates with the Gov phenotype. In addition, Chinese hamster ovary cells transiently expressing nucleotide 2108 A>C CD109 cDNA variants were recognized specifically by allele-specific Gov antisera, indicating that this polymorphism defines the Gov alloantigenic determinants. Real-time PCR was then used to genotype 85 additional Gov phenotyped donors. In all but 3 cases, genomic testing concurred with the Gov phenotype. Repeat testing corrected 2 of these discrepancies in favor of the genotyping result. The third discrepancy could not be resolved, likely reflecting low-level CD109 expression below the sensitivity of the phenotyping assay. We conclude that the Gov alleles are defined by a 2108 A>C SNP that results in a Tyr703Ser substitution of CD109 and that genotyping studies are more accurate for Gov alloantigen determination than are conventional serologic methods.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».