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Enregistrement W2139347509 · doi:10.1128/iai.73.9.5995-6004.2005

<i>Bordetella pertussis risA</i> , but Not <i>risS</i> , Is Required for Maximal Expression of Bvg-Repressed Genes

2005· article· en· W2139347509 sur OpenAlexaff
Trevor H. Stenson, Andrew G. Allen, Jehan A. al-Meer, Duncan J. Maskell, M S Peppler

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésBordetella pertussisBiologyGeneBordetellaMutantVirulenceMutationGeneticsMicrobiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Expression of virulence determinants by Bordetella pertussis, the primary etiological agent of whooping cough, is regulated by the BvgAS two-component regulatory system. The role of a second two-component regulatory system, encoded by risAS, in this process is not defined. Here, we show that mutation of B. pertussis risA does not affect Bvg-activated genes or proteins. However, mutation of risA resulted in greatly diminished expression of Bvg-repressed antigens and decreased transcription of Bvg-repressed genes. In contrast, mutation of risS had no effect on the expression of Bvg-regulated molecules. Mutation of risA also resulted in decreased bacterial invasion in a HeLa cell model. However, decreased invasion could not be attributed to the decreased expression of Bvg-repressed products, suggesting that mutation of risA may affect the expression of a variety of genes. Unlike the risAS operons in B. parapertussis and B. bronchiseptica, B. pertussis risS is a pseudogene that encodes a truncated RisS sensor. Deletion of the intact part of the B. pertussis risS gene does not affect the expression of risA-dependent, Bvg-repressed genes. These observations suggest that RisA activation occurs through cross-regulation by a heterologous system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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