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Enregistrement W2139347878 · doi:10.1101/cshperspect.a008714

Mechanisms of Action of Bcl-2 Family Proteins

2013· review· en· W2139347878 sur OpenAlexaff
Aisha Shamas‐Din, Justin Kale, Brian Leber, David W. Andrews

Notice bibliographique

RevueCold Spring Harbor Perspectives in Biology · 2013
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBcl-2 familyCell biologyCytoplasmFunction (biology)Protein familyApoptosisMitochondrionMembrane proteinMembraneBiochemistryProgrammed cell deathGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Bcl-2 family of proteins controls a critical step in commitment to apoptosis by regulating permeabilization of the mitochondrial outer membrane (MOM). The family is divided into three classes: multiregion proapoptotic proteins that directly permeabilize the MOM; BH3 proteins that directly or indirectly activate the pore-forming class members; and the antiapoptotic proteins that inhibit this process at several steps. Different experimental approaches have led to several models, each proposed to explain the interactions between Bcl-2 family proteins. The discovery that many of these interactions occur at or in membranes as well as in the cytoplasm, and are governed by the concentrations and relative binding affinities of the proteins, provides a new basis for rationalizing these models. Furthermore, these dynamic interactions cause conformational changes in the Bcl-2 proteins that modulate their apoptotic function, providing additional potential modes of regulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations704
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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