Amplification of the Second Internal Transcribed Spacer Ribosomal DNA of Individual Trichostrongylid Nematode Larvae by Nested Polymerase Chain Reaction
Notice bibliographique
Résumé
The second internal transcribed spacer (ITS2) of ribosomal DNA (rDNA) is used as a genetic marker to identify trichostrongylid nematodes. However, it is often difficult to amplify by polymerase chain reaction (PCR) the ITS2 rDNA of a single trichostrongylid nematode larva or egg. A nested PCR (nPCR) assay was, therefore, developed to amplify the ITS2 from individual trichostrongylid nematode larvae. The results show that the ITS2 rDNA of a significantly greater proportion of individual larvae was amplified using nPCR compared with a standard PCR. There was also no need to column-purify the genomic DNA before nPCR, which is more time and cost effective for studies involving large sample sizes. The amplicons produced from the secondary phase of the nPCR were subjected to single-strand conformation polymorphism analyses and DNA sequencing to confirm the species identity of the larvae used in the current study as Ostertagia gruehneri. The nPCR assay was also used to amplify the ITS2 from individual trichostrongylid eggs. The ability to amplify the ITS2 rDNA from large numbers of individual nematode eggs and larvae has important implications for diagnostic testing and for conducting epidemiological studies on these parasites of veterinary importance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».