Detection of Species-Specific <i>Helicobacter</i> Ribosomal DNA in Intestinal Biopsy Samples from a Population-Based Cohort of Patients with Ulcerative Colitis
Notice bibliographique
Résumé
The inflammatory bowel diseases are considered an abnormal host immune response to an environmental stimulus. Evidence suggests a role for intestinal bacteria in initiating and/or providing an ongoing stimulus for inflammation in inflammatory bowel disease. Helicobacter pylori is the major cause of active chronic gastritis and peptic ulcers in humans and has been linked to gastric carcinoma and lymphoma. Studies in various animal models, particularly mice, have identified enterohepatic Helicobacter species that are capable of causing hepatitis and enterocolitis. We hypothesize that Helicobacter species may have a role in maintaining inflammation in humans with inflammatory bowel disease. In order to investigate this, biopsy specimens were obtained from patients with and without inflammatory bowel disease. DNA was extracted from the tissues and subjected to PCR with primers designed to detect the ribosomal DNA of members of the Helicobacter species. DNA from six biopsy samples from 60 inflammatory bowel disease patients tested positive. This included 5 of 33 ulcerative colitis patients that were positive compared to 0 of 29 age-matched controls (P < 0.04). Sequencing of the bands produced by PCR amplification revealed >or=99% homology with H. pylori. These results indicate that a member of the Helicobacter species may be involved in some cases of ulcerative colitis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».