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Enregistrement W2139378255 · doi:10.1139/w00-095

Heat shock protein 80 of<i>Neurospora crassa</i>: Sequence analysis of the gene and expression during the asexual phase

2000· article· en· W2139378255 sur OpenAlexafffundvenue
Tara L. Girvitz, P M Ouimet, M. Kapoor

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésNeurospora crassaBiologyGeneNucleic acid sequenceMolecular biologyGeneticsNeurosporaHeat shock proteinPeptide sequenceSequence analysisIntronCoding regionHSPA14Complementary DNAHSPA2

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heat shock protein 80 (Hsp80) of Neurospora crassa, a member of the stress-90 protein family, is a cytosolic molecular chaperone that interacts directly with Hsp70 to form a hetero-oligomeric complex. The complete nucleotide sequence of the gene encoding this protein, along with the 5'- and 3'-flanking DNA, is reported. The coding sequence is interrupted by two introns, 61 and 30 nucleotides, respectively, in length. The deduced amino acid sequence corresponds to a 695-residue polypeptide with a calculated molecular mass of 78,894 Da and an average pI of 4.94. Primer extension experiments demonstrated two transcription start sites, a major and a minor one. No sequence motifs resembling the standard eukaryotic heat shock elements were evident in the putative promoter region. Immunoblot analysis showed Hsp80 protein to be present in the mature, dormant conidia, while the hsp80 transcripts were not detected. Both the transcripts and the protein were present in the germinating conidia in the absence of externally applied stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2000
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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