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Enregistrement W2139412702 · doi:10.1139/g06-052

Characterization of genetic loci conferring adult plant resistance to leaf rust and stripe rust in spring wheat

2006· article· en· W2139412702 sur OpenAlexvenueno aff
H. M. William, Ravi P. Singh, Julio Huerta‐Espino, Gustavo Palacios, Kazuhiro Suenaga

Notice bibliographique

RevueGenome · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBulked segregant analysisLocus (genetics)PopulationAmplified fragment length polymorphismGeneticsGenetic linkageRust (programming language)GermplasmGene mappingCultivarChromosomeBotanyGeneGenetic diversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Leaf (brown) and stripe (yellow) rusts, caused by Puccinia triticina and Puccinia striiformis, respectively, are fungal diseases of wheat (Triticum aestivum) that cause significant yield losses annually in many wheat-growing regions of the world. The objectives of our study were to characterize genetic loci associated with resistance to leaf and stripe rusts using molecular markers in a population derived from a cross between the rust-susceptible cultivar 'Avocet S' and the resistant cultivar 'Pavon76'. Using bulked segregant analysis and partial linkage mapping with AFLPs, SSRs and RFLPs, we identified 6 independent loci that contributed to slow rusting or adult plant resistance (APR) to the 2 rust diseases. Using marker information available from existing linkage maps, we have identified additional markers associated with resistance to these 2 diseases and established several linkage groups in the 'Avocet S' x 'Pavon76' population. The putative loci identified on chromosomes 1BL, 4BL, and 6AL influenced resistance to both stripe and leaf rust. The loci on chromosomes 3BS and 6BL had significant effects only on stripe rust, whereas another locus, characterized by AFLP markers, had minor effects on leaf rust only. Data derived from Interval mapping indicated that the loci identified explained 53% of the total phenotypic variation (R2) for stripe rust and 57% for leaf rust averaged across 3 sets of field data. A single chromosome recombinant line population segregating for chromosome 1B was used to map Lr46/Yr29 as a single Mendelian locus. Characterization of slow-rusting genes for leaf and stripe rust in improved wheat germplasm would enable wheat breeders to combine these additional loci with known slow-rusting loci to generate wheat cultivars with higher levels of slow-rusting resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations186
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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