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Enregistrement W2139423168 · doi:10.1002/cbic.201300385

Potential Rearrangements in the Reaction Catalyzed by the Indole Prenyltransferase FtmPT1

2013· article· en· W2139423168 sur OpenAlexaff
Niusha Mahmoodi, Martin E. Tanner

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrenyltransferasePrenylationIndole testChemistryCatalysisStereochemistryReactivity (psychology)TryptophanCombinatorial chemistryEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The indole prenyltransferase FtmPT1 catalyzes the C-2 normal prenylation of brevianamide F (cyclo-L-Trp-L-Pro) to give tryprostatin B. A previous structural analysis and studies with alternate substrates suggest that the reaction might not proceed through a direct C-2 attack, but could involve a C-3 prenylation followed by a rearrangement. In this work we investigated the reactivity of FtmPT1 with tryptophan, 5-hydroxybrevianamide, and 2-methylbrevianamide, and isolated products that had been reverse prenylated at C-3 and normal prenylated at N-1, C-3, or C-4. The formation of these products can be rationalized through mechanisms involving either an initial C-3 normal or C-3 reverse prenylation. In addition, we demonstrate that a C-3 reverse prenylated indole can undergo a nonenzymatic aza-Cope rearrangement at 37 °C to give an N-1 normal prenylated product. Together, these studies broaden the known product scope of this interesting catalyst and suggest that alternative mechanisms might be operating.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,262

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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