Hierarchical phosphorylation of the translation inhibitor 4E-BP1
Notice bibliographique
Résumé
In most instances, translation is regulated at the initiation phase, when a ribosome is recruited to the 5' end of an mRNA. The eIF4E-binding proteins (4E-BPs) interdict translation initiation by binding to the translation factor eIF4E, and preventing recruitment of the translation machinery to mRNA. The 4E-BPs inhibit translation in a reversible manner. Hypophosphorylated 4E-BPs interact avidly with eIF4E, whereas 4E-BP hyperphosphorylation, elicited by stimulation of cells with hormones, cytokines, or growth factors, results in an abrogation of eIF4E-binding activity. We reported previously that phosphorylation of 4E-BP1 on Thr 37 and Thr 46 is relatively insensitive to serum deprivation and rapamycin treatment, and that phosphorylation of these residues is required for the subsequent phosphorylation of a set of unidentified serum-responsive sites. Here, using mass spectrometry, we identify the serum-responsive, rapamycin-sensitive sites as Ser 65 and Thr 70. Utilizing a novel combination of two-dimensional isoelectric focusing/SDS-PAGE and Western blotting with phosphospecific antibodies, we also establish the order of 4E-BP1 phosphorylation in vivo; phosphorylation of Thr 37/Thr 46 is followed by Thr 70 phosphorylation, and Ser 65 is phosphorylated last. Finally, we show that phosphorylation of Ser 65 and Thr 70 alone is insufficient to block binding to eIF4E, indicating that a combination of phosphorylation events is necessary to dissociate 4E-BP1 from eIF4E.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».