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Enregistrement W2139440265 · doi:10.1128/mcb.02300-06

Distinct Structural Features ofCaprin-1 Mediate Its Interaction with G3BP-1 and Its Induction of Phosphorylation of Eukaryotic Translation InitiationFactor 2 <i>α</i> , Entry to Cytoplasmic Stress Granules, and Selective Interaction with a Subset of mRNAs

2007· article· en· W2139440265 sur OpenAlexafffund
Samuel G. Solomon, Yaoxian Xu, Bin Wang, Muriel D. David, Peter Schubert, Derek Kennedy, John W. Schrader

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Arthritis NetworkUniversity of Toronto
Mots-clésStress granuleBiologyCytoplasmPhosphorylationCell biologyTranslation (biology)EIF4EPhosphoproteinRNA-binding proteinMessenger RNAMolecular biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Caprin-1 is a ubiquitously expressed, well-conserved cytoplasmic phosphoprotein that is needed for normal progression through the G(1)-S phase of the cell cycle and occurs in postsynaptic granules in dendrites of neurons. We demonstrate that Caprin-1 colocalizes with RasGAP SH3 domain binding protein-1 (G3BP-1) in cytoplasmic RNA granules associated with microtubules and concentrated in the leading and trailing edge of migrating cells. Caprin-1 exhibits a highly conserved motif, F(M/I/L)Q(D/E)Sx(I/L)D that binds to the NTF-2-like domain of G3BP-1. The carboxy-terminal region of Caprin-1 selectively bound mRNA for c-Myc or cyclin D2, this binding being diminished by mutation of the three RGG motifs and abolished by deletion of the RGG-rich region. Overexpression of Caprin-1 induced phosphorylation of eukaryotic translation initiation factor 2alpha (eIF-2alpha) through a mechanism that depended on its ability to bind mRNA, resulting in global inhibition of protein synthesis. However, cells lacking Caprin-1 exhibited no changes in global rates of protein synthesis, suggesting that physiologically, the effects of Caprin-1 on translation were limited to restricted subsets of mRNAs. Overexpression of Caprin-1 induced the formation of cytoplasmic stress granules (SG). Its ability to bind RNA was required to induce SG formation but not necessarily its ability to enter SG. The ability of Caprin-1 or G3BP-1 to induce SG formation or enter them did not depend on their association with each other. The Caprin-1/G3BP-1 complex is likely to regulate the transport and translation of mRNAs of proteins involved with synaptic plasticity in neurons and cellular proliferation and migration in multiple cell types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations271
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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