Extending the Limited Transfer Window Hypothesis to Inter-organelle DNA Migration
Notice bibliographique
Résumé
Mitochondrial genomes often contain large amounts of plastid DNA (ptDNA)-derived sequences (MTPTs). It has been suggested that the intercompartmental transfer of ptDNA is greatly reduced in species with only a single plastid per cell (monoplastidic) as compared with those with many plastids per cell (polyplastidic). This hypothesis has not been applied to the movement of DNA from plastids to mitochondria. By analyzing the organelle genomes from diverse mono- and polyplastidic taxa, I show that MTPTs are restricted to the mitochondrial genomes of species with many plastids per cell and are absent from those with one plastid per cell or with monoplastidic meristematic systems. Moreover, the most bloated mitochondrial genomes that were explored had the largest MTPT contents. These data, like previous results on ptDNA-derived sequences in nuclear genomes, support the hypothesis that plastid number and the forces governing the expansion and contraction of noncoding mitochondrial DNA (mtDNA) influence MTPT abundance. I also show that plastid genomes are depauperate in mtDNA-derived sequences (PTMTs), irrespective of the number of mitochondria per cell and plastid genome size, which may reflect the lack of a DNA uptake system in plastids.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».