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Enregistrement W2139489391 · doi:10.1139/g08-001

Allelism and molecular mapping of soybean necrotic root mutants

2008· article· en· W2139489391 sur OpenAlexvenueno aff
Reid G. Palmer, Lei Zhang, Zhiping Huang, Min Xu

Notice bibliographique

RevueGenome · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGeneticsLocus (genetics)MutantAlleleGenePopulationMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutability of the w4 flower color locus in soybean, Glycine max (L.) Merr., is conditioned by an allele designated w4-m. Germinal revertants recovered among self-pollinated progeny of mutable plants have been associated with the generation of necrotic root mutations, chlorophyll-deficiency mutations, and sterility mutations. A total of 24 necrotic root mutant lines were generated from a total of 24 independent reversion events at the w4-m locus. The initial mutable population included 4 mutable categories for w4-m, designated (1) low frequency of early excisions, (2) low frequency of late excisions, (3) high frequency of early excisions, and (4) high frequency of late excisions. These mutable categories were based upon flower phenotype, i.e., somatic tissue. A total of 22 of 24 necrotic root mutations occurred from germinal reversions classified in the high frequency of excision categories. Of these 22 mutants, 14 came from early excisions and 8 came from late excisions. These necrotic root mutants were allelic to 6 previously identified necrotic root mutants derived from the study of germinal revertants, i.e., gene tagging studies, chemical mutagenesis, and "spontaneous" occurrences from genetic crosses. Thus, all 30 necrotic root mutants in soybean are allelic. An F2 mapping population from the cross of Minsoy (Rn1 Rn1) x T328 (rn1 rn1) was used to map the Rn1 locus using simple sequence repeat (SSR) markers. The Rn1 locus was located between Satt288 and Satt612 on molecular linkage group G.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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