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Enregistrement W2139490599 · doi:10.4161/chan.24163

CRACking the structure of Orai

2013· letter· en· W2139490599 sur OpenAlexaff
Andrew P. Braun

Notice bibliographique

RevueChannels · 2013
Typeletter
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueIon Channels and Receptors
Établissements canadiensAlberta Bible CollegeUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSTIM1Endoplasmic reticulumCell biologyTransmembrane proteinOrganelleCalcium signalingSecond messenger systemORAI1CalciumChemistryVoltage-dependent calcium channelSignal transductionBiologyBiochemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calcium (Ca2+) is well recognized as a key second messenger in a variety of eukaryotic signal transduction pathways, and nature has developed a number of regulatory mechanisms to mediate its cellular influx and efflux and its homeostasis within the cell. Stimulus-evoked release of Ca2+ stored within internal organelles (i.e., endoplasmic and/or sacroplasmic reticulum) is known to trigger the subsequent influx of external Ca2+ as a means to replenish the internal store, and a flurry of studies over the past 5–10 y have demonstrated that this influx process involves two main molecular players; STIM1, a transmembrane Ca2+ sensor protein localized to the internal storage organelle and Orai, an integral plasma membrane protein that mediates Ca2+ entry in response to store depletion. Cahalan and coworkers initially identified STIM1 as a novel Ca2+-binding protein through use of a comprehensive siRNA-based screen of candidate molecules in Drosophila S2 cells whose loss could impact evoked Ca2+ entry.1 A year later, Orai was discovered through genetic mapping studies of a novel mutation associated with impaired lymphocyte function and severe immunodeficiency in patients,2 and was subsequently found to be an integral plasma membrane component of the calcium influx channel. The latter studies revealed that lymphocyte dysfunction was associated with a loss of evoked calcium influx in these cells, which correlated with a single Arg to Trp amino acid substitution in the first predicted transmembrane segment of Orai1. More recently, investigators have reported that Orai protein monomers are able to co-assemble to form a Ca2+-selective cation channel that may be activated by interaction with STIM1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,412
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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