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Enregistrement W2139807039 · doi:10.1210/me.2003-0405

Binding of AP-2 and ETS-Domain Family Members Is Associated with Enhancer Activity in the Hypersensitive Site III Region of the Human Growth Hormone/Chorionic Somatomammotropin Locus

2003· article· en· W2139807039 sur OpenAlexafffund
Yan Jin, Lisa Norquay, Xiaoyang Yang, Scott Gregoire, Peter A. Cattini

Notice bibliographique

RevueMolecular Endocrinology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGrowth Hormone and Insulin-like Growth Factors
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyMolecular biologyEnhancerTransfectionPlacental lactogenGene expressionGenePlacentaGeneticsFetus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human GH gene family is specifically expressed in somatotrophs of the anterior pituitary and placental syncytiotrophoblast. Two nuclease-hypersensitive sites, HS III and HS V, are associated with a region of chromatin located 28 and 30 kb upstream of the pituitary GH gene transcription initiation site (+1) in both pituitary and placenta nuclei. A role for this region in pituitary GH gene expression has been reported, but the potential relevance to placental gene expression has not been determined. Deletion analysis of a 5.2-kb region (nucleotides - 27,568/-32,746) containing HS III to V-related sequences localized significant enhancer activity to a 574-bp HS III fragment (nucleotides -27,676/-28,249) in multiple transfected cell lines. Four nuclease-protected regions [footprints (FP) 1-4] were identified in the 574-bp fragment. FP2 and FP3 were detected with placenta cell nuclear protein, whereas FP1 and FP4 were observed with placental and nonplacental cell nuclear extract. Disruption of FP1 had no effect on heterologous promoter activity in transfected pituitary and placental cells, whereas loss of FP2 and FP3 resulted in modest increases in placental cells, reflecting the presence of repressor activity associated with these regions in vitro. In contrast, disruption of the FP4 region by mutation or deletion significantly reduced enhancer activity. As a result, 30-fold enhancer activity was localized to a 41-bp region in transfected placental tumor cells. Binding of candidate proteins, activator protein (AP)-2 (FP3) and Elk-1 (FP4), was confirmed using competition assays with specific oligonucleotides and antibodies. Moreover, these factors were associated with the hyperacetylated HS III region in human pituitary [activator protein 2 (AP-2) and Elk-1] and term placenta (AP-2) chromatin. These data implicate AP-2 and ETS-domain family members in the regulation of the GH/CS locus and raise the possibility that different complexes form in the HS III region in placenta and pituitary cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,252
Score d'incertitude au seuil0,670

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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