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Enregistrement W2139820514 · doi:10.1128/jvi.01152-05

Analyses of Phosphorylation Events in the Rubella Virus Capsid Protein: Role in Early Replication Events

2006· article· en· W2139820514 sur OpenAlexaff
LokMan J. Law, Carolina S. Ilkow, Wen‐Pin Tzeng, Matthew Rawluk, Teryl K. Frey, Tom C. Hobman

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVirology and Viral Diseases
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCapsidPhosphorylationBiologyRNAViral replicationVirusCapsomereCell biologyRubella virusProtein phosphorylationVirologyBiochemistryGeneProtein kinase ARubella

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Rubella virus capsid protein is phosphorylated prior to virus assembly. Our previous data are consistent with a model in which dynamic phosphorylation of the capsid regulates its RNA binding activity and, in turn, nucleocapsid assembly. In the present study, the process of capsid phosphorylation was examined in further detail. We show that phosphorylation of serine 46 in the RNA binding region of the capsid is required to trigger phosphorylation of additional amino acid residues that include threonine 47. This residue likely plays a direct role in regulating the binding of genomic RNA to the capsid. We also provide evidence which suggests that the capsid is dephosphorylated prior to or during virus budding. Finally, whereas the phosphorylation state of the capsid does not directly influence the rate of synthesis of viral RNA and proteins or the assembly and secretion of virions, the presence of phosphate on the capsid is critical for early events in virus replication, most likely the uncoating of virions and/or disassembly of nucleocapsids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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