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Enregistrement W2139823039 · doi:10.1128/jvi.02443-06

Inhibition of Transcription of the Beta Interferon Gene by the Human Herpesvirus 6 Immediate-Early 1 Protein

2007· article· en· W2139823039 sur OpenAlexafffund
Joanna Jaworska, Annie Gravel, Karin Fink, Nathalie Grandvaux, Louis Flamand

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Saint-LucUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyIRF3Sendai virusInterferonMolecular biologyGene expressionInterferon regulatory factorsTransfectionGeneRegulation of gene expressionEctopic expressionInterferon type IVirologyTranscription factorVirusGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human herpesviruses (HHV) are stealth pathogens possessing several decoy or immune system evasion mechanisms favoring their persistence within the infected host. Of these viruses, HHV-6 is among the most successful human parasites, establishing lifelong infections in nearly 100% of individuals around the world. To better understand this host-pathogen relationship, we determined whether HHV-6 could interfere with the development of the innate antiviral response by affecting interferon (IFN) biosynthesis. Using inducible cell lines and transient transfection assays, we have identified the immediate-early 1 (IE1) protein as a potent inhibitor of IFN-beta gene expression. IE1 proteins from both HHV-6 variants were capable of suppressing IFN-beta gene induction. IE1 prevents IFN-beta gene expression triggered by Sendai virus infection, double-stranded RNA (dsRNA) and dsDNA transfection, or the ectopic expression of IFN-beta gene activators such as retinoic inducible gene I protein, mitochondrial antiviral signaling protein, TBK-1, IkappaB kinase epsilon (IKKepsilon), and IFN regulatory factor 3 (IRF3). While the stability of IFN-beta mRNA is not affected, IE1-expressing cells have reduced levels of dimerized IRF3 and nucleus-translocated IRF3 in response to activation by TBK-1 or IKKepsilon. Using nuclear extracts and gel shift experiments, we could demonstrate that in the presence of IE1, IRF3 does not bind efficiently to the IFN-beta promoter sequence. Overall, these results indicate that the IE1 protein of HHV-6, one of the first viral proteins synthesized upon viral entry, is a potent suppressor of IFN-beta gene induction and likely contributes to favor the establishment of and successful infection of cells with this virus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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