Genetic diversity of the major histocompatibility complex region in commercial and noncommercial chicken flocks using the LEI0258 microsatellite marker
Notice bibliographique
Résumé
Microsatellite marker LEI0258 was used as an indicator to examine the variability of the major histocompatibility complex (MHC) region in 2 commercial layer flocks, 1 experimental layer cross, and 5 noncommercial flocks (used for free-run and free-range meat and egg production). We hypothesized that the populations from noncommercial sources may have more diversity in MHC genes than that in the commercial-source populations. Two related parameters, heterozygosity and the number of alleles harbored by a population, were used to assess the genetic variability. The different combinations of the 22 alleles created 66 genotypes in the 8 chicken populations that were studied. The noncommercial populations, except for the Silkies (SK), harbored more alleles than those in the 2 commercial populations, Lohmann Brown and Lohmann White. The observed heterozygosity of the MHC region was high in all of the populations, except for SK. Considering the 2 parameters we have examined, we can generalize that the intensively selected commercial egg-layer varieties seem to have less genetic variability in their MHC regions compared with that of the noncommercial flocks, which are less intensively selected. The LEI0258 variants can be used as markers to detect most of the MHC haplotypes, but in the different populations the same allele size may not always be associated with the same serologically defined haplotype. The information obtained from this study will be useful for genetic resource conservation and the development of breeding stocks that are suitable for free-range production.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».