High proportions of nonpathogenic Streptomyces are associated with common scab-resistant potato lines and less severe disease
Notice bibliographique
Résumé
Streptomyces isolates were obtained from potato tubers with common scab lesions from 2 fields over a 3 year period in Minnesota and a 5 year period in Maine. Isolates were obtained from different potato cultivars or breeding lines and types of scab lesions. A majority of isolates could be classified as putative pathogens based on the presence of genes for biosynthesis of the pathogenicity determinant, thaxtomin, but large numbers of streptomycetes lacking genes for thaxtomin biosynthesis (presumably nonpathogenic) were also recovered. Most Streptomyces isolates recovered from raised and pitted lesions were pathogens, whereas mostly nonpathogenic isolates were recovered from unblemished potato skin or nonscab lesions. Fewer pathogenic than nonpathogenic isolates were recovered from the most resistant potato lines. The proportion and diversity of nonpathogenic isolates recovered was higher in Maine than in Minnesota. The association between greater numbers of nonpathogenic Streptomyces and less severe common scab suggests that the interaction between plant genotype and Streptomyces microbial community is important in determining the severity of common scab on potato, and emphasizes the role of complex interactions between plants and microbial populations on and near plant roots in plant disease outcomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».