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Enregistrement W2139920423 · doi:10.1093/neuonc/nou052

Germline rearrangements in families with strong family history of glioma and malignant melanoma, colon, and breast cancer

2014· article· en· W2139920423 sur OpenAlexaff
Ulrika Andersson, Carl Wibom, K. Cederquist, S. Aradottir, Åke Borg, Georgina Armstrong, Sanjay Shete, Ching C. Lau, Matthew N. Bainbridge, Elizabeth B. Claus, Jill S. Barnholtz‐Sloan, Raymond Lai, D. Il'yasova, Richard S. Houlston, Joellen M. Schildkraut, Jonine L. Bernstein, Sara H. Olson, Robert B. Jenkins, Daniel H. Lachance, Margaret Wrensch, Faith G. Davis, Ryan Merrell, Christoffer Johansen, Siegal Sadetzki, Melissa L. Bondy, Beatrice Melin, Phyllis Adatto, F. Morice, Sandra Payen, Lacey McQuinn, Rebecca McGaha, S. Guerra, L. Paith, Katherine G. Roth, Dong Zeng, Hua Zhang, Alfred Yung, Ken Aldape, Mark R. Gilbert, James M. Weinberger, Howard Colman, C. Conrad, John de Groot, Axel Forman, Morris D. Groves, Victor A. Levin, Monica Loghin, Vinay K. Puduvalli, Raymond Sawaya, Amy B. Heimberger, F. Lang, Nicholas B. Levine, Lorna Tolentino, Katherine C. Saunders, Tine Thach, Donatella Iacono, Anthony Sloan, Stanton L. Gerson, Warren R. Selman, Nicholas C. Bambakidis, Daniel Hart, Jacob A. Miller, Alan Hoffer, Mark L. Cohen, Lisa R. Rogers, C. J. Nock, Yingli Wolinsky, Karen Devine, Jordonna Fulop, William Barrett, Kristen Shimmel, Quinn T. Ostrom, Gene H. Barnett, S. Rosenfeld, Michael A. Vogelbaum, Richard Weil, Manmeet S. Ahluwalia, D. Peereboom, Susan M. Staugaitis, Cathy Schilero, Cathy Brewer, Kathy Smolenski, M. McGraw, Theresa Naska, Zvi Ram, Deborah T. Blumenthal, Felix Bokstein, Félix Umansky, Menashe Zaaroor, Andrea J. Cohen, Tzahala Tzuk-Shina, B. Voldby, Rasmus Laursen, Christen Lykkegaard Andersen, Jannick Brennum, Marius Henriksen, M Marzouk, Mary E. Davis, Elizabeth A. Boland, Michael J. Smith, Ogechukwu Eze, Michael Way, Paul Eduardo Lada, N. Miedzianowski, M. Frechette, Nina A. Paleologos, G. Bystrom, Erika Svedberg, S. Huggert, Mikael Kimdal, Maria Sandström, Niklas Brännström, Tarık Tihan, Sarah Y. Zheng, Michael Berger, Nicholas Butowski, Susan M. Chang, Jennifer Clarke, Michael D. Prados, Terri Rice, Julian Sison, Valerie Kivett, X. Duo, Helen Hansen, George Hsuang, R A Lamela, Christian G. Ramos, Joseph Patoka, K. Wagenman, Mi Zhou, Alison P. Klein, Nathan R. McGee, Jon Pfefferle, Charmaine D. Wilson, Patrick G. Morris, Mark Hughes, M. Britt-Williams, Jessica Foft, Jacob Madsen, C. Polony, Bridget J. McCarthy, C. Zahora, John L. Villano, Herbert H. Engelhard, S. K. Chanock, Peter Collins, Robert C. Elston, Paul Kleihues, Carol Kruchko, Gloria Petersen, Sharon E. Plon, Patrick Thompson, Michael E. Scheurer, Ying Liu, Robert Yu, Jeffrey S. Weinberg, Fay J. Hosking, Lindsay B. Robertson, Elli Papaemmanuil, A. E. Sloan, Roberta McKean‐Cowdin, Galit Hirsh Yechezkel, Revital Bruchim, L. A. Aslanov, Michael Kosteljanetz, Helle Broholm, Erin K. Schubert, Lisa M. DeAngelis, Peter Yang, Amanda L. Rynearson, Roger Henriksson, John Wiencke, Joseph L. Wiemels, Lucie McCoy

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignNational Institutes of HealthRigshospitaletLunds UniversitetCase Comprehensive Cancer Center, Case Western Reserve UniversityMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterDan L. Duncan Cancer Center, Baylor College of MedicineSchool of Medicine, Case Western Reserve UniversityNational Cancer InstituteNational Brain Tumor SocietyCase Western Reserve UniversityBrigham and Women's HospitalUniversity of Southern CaliforniaUniversity of California, San FranciscoCancer Research UKYale University
Mots-clésGermlineMelanomaBreast cancerFamily historyOncologyColorectal cancerMedicineInternal medicineCancerCancer researchBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Although familial susceptibility to glioma is known, the genetic basis for this susceptibility remains unidentified in the majority of glioma-specific families. An alternative approach to identifying such genes is to examine cancer pedigrees, which include glioma as one of several cancer phenotypes, to determine whether common chromosomal modifications might account for the familial aggregation of glioma and other cancers. METHODS: Germline rearrangements in 146 glioma families (from the Gliogene Consortium; http://www.gliogene.org/) were examined using multiplex ligation-dependent probe amplification. These families all had at least 2 verified glioma cases and a third reported or verified glioma case in the same family or 2 glioma cases in the family with at least one family member affected with melanoma, colon, or breast cancer.The genomic areas covering TP53, CDKN2A, MLH1, and MSH2 were selected because these genes have been previously reported to be associated with cancer pedigrees known to include glioma. RESULTS: We detected a single structural rearrangement, a deletion of exons 1-6 in MSH2, in the proband of one family with 3 cases with glioma and one relative with colon cancer. CONCLUSIONS: Large deletions and duplications are rare events in familial glioma cases, even in families with a strong family history of cancers that may be involved in known cancer syndromes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,321
Score d'incertitude au seuil0,456

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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