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Enregistrement W2139940827 · doi:10.3892/ol.2015.3414

Ethnicity affects EGFR and KRAS gene alterations of lung adenocarcinoma

2015· article· en· W2139940827 sur OpenAlexaff
Junichi Soh, Shinichi Toyooka, Keitaro Matsuo, Hiromasa Yamamoto, Ignacio I. Wistuba, Stephen Lam, Kwun M. Fong, Adi F. Gazdar, Shinichiro Miyoshi

Notice bibliographique

RevueOncology Letters · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensOccupational Cancer Research Centre
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteChiba University
Mots-clésKRASOncogeneMolecular medicineAdenocarcinomaEthnic groupCell cycleGeneOncologyCancer researchMedicineLung cancerInternal medicineCancerBiologyGeneticsColorectal cancerPolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations or copy number gains (CNGs) of the EGFR and KRAS genes are representative alterations in lung adenocarcinomas that are individually associated with patient characteristics such as ethnicity, smoking status and gender. However, the effects of combinations of these genetic alterations have not been statistically examined. The present study analyzed previously examined lung adenocarcinoma cases in Asian (n=166) and non‑Asian (n=136) individuals in whom all four EGFR and KRAS alterations had been studied. The polynomial logistic regression models were used following adjustment for gender and smoking status, and using patients without any type of EGFR/KRAS alterations as a reference. Between the two ethnic groups, EGFR CNGs (gEGFR) occurred more frequently than EGFR mutations (mEGFR) (46 vs. 38% in Asians; 21 vs. 10% in non‑Asians), whereas KRAS mutations (mKRAS) were more frequent than KRAS CNGs (gKRAS) (13 vs. 7% and 35 vs. 4%, respectively). Additionally, gEGFR and gKRAS occurred significantly more frequently in respective mutant cases, and all EGFR alterations were almost exclusive of all KRAS alterations. The polynomial logistic regression models confirmed that all types of EGFR alterations were significantly more frequent among Asian individuals than among non‑Asian individuals, independent of gender and smoking status (odds ratios, 2.36‑6.67). KRAS alterations occurred less frequently among Asian individuals than among non‑Asian individuals, although a significant difference was not detected. The present study results indicated that the EGFR and KRAS profiles, including mutations and CNGs, differ between Asian and non‑Asian individuals with lung adenocarcinoma, suggesting that ethnicity strongly affects the molecular characteristics of lung adenocarcinoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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