Structures of two core subunits of the bacterial type IV secretion system, VirB8 from <i>Brucella suis</i> and ComB10 from <i>Helicobacter pylori</i>
Notice bibliographique
Résumé
Type IV secretion systems (T4SSs) are commonly used secretion machineries in Gram-negative bacteria. They are used in the infection of human, animal, or plant cells and the propagation of antibiotic resistance. The T4SS apparatus spans both membranes of the bacterium and generally is composed of 12 proteins, named VirB1-11 and VirD4 after proteins of the canonical Agrobacterium tumefaciens T4SS. The periplasmic core complex of VirB8/VirB10 structurally and functionally links the cytoplasmic NTPases of the system with its outer membrane and pilus components. Here we present crystal structures of VirB8 of Brucella suis, the causative agent of brucellosis, and ComB10, a VirB10 homolog of Helicobacter pylori, the causative agent of gastric ulcers. The structures of VirB8 and ComB10 resemble known folds, albeit with novel secondary-structure modifications unique to and conserved within their respective families. Both proteins crystallized as dimers, providing detailed predictions about their self associations. These structures make a substantial contribution to the repertoire of T4SS component structures and will serve as springboards for future functional and protein-protein interaction studies by using knowledge-based site-directed and deletion mutagenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».