MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2140019924 · doi:10.1074/jbc.275.19.14223

Binding of Multivalent Carbohydrates to Concanavalin A andDioclea grandiflora Lectin

2000· article· en· W2140019924 sur OpenAlexaff
Tarun K. Dam, René Roy, Sanjoy K. Das, Stefan Oscarson, C. Fred Brewer

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésConcanavalin AChemistryIsothermal microcalorimetryLectinValencyCarbohydrateTitrationIsothermal titration calorimetryStereochemistryBiochemistryEnthalpyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Binding of a series of synthetic multivalent carbohydrate analogs to the Man/Glc-specific lectins concanavalin A and Dioclea grandiflora lectin was investigated by isothermal titration microcalorimetry. Dimeric analogs possessing terminal alpha-D-mannopyranoside residues, and di-, tri-, and tetrameric analogs possessing terminal 3, 6-di-O-(alpha-D-mannopyranosyl)-alpha-D-mannopyranoside residues, which is the core trimannoside of asparagine-linked carbohydrates, were selected in order to compare the effects of low and high affinity analogs, respectively. Experimental conditions were found that prevented precipitation of the carbohydrate-lectin cross-linked complexes during the isothermal titration microcalorimetry experiments. The results show that the value of n, the number of binding sites on each monomer of the lectins, is inversely proportional to the number of binding epitopes (valency) of each carbohydrate. Hence, n values close to 1.0, 0.50, and 0.25 were observed for the binding of mono-, di-, and tetravalent sugars, respectively, to the two lectins. Importantly, differences in the functional valency of a triantennary analog for concanavalin A and D. grandiflora lectin are observed. The enthalpy of binding, DeltaH, is observed to be directly proportional to the number of binding epitopes in the higher affinity analogs. For example, DeltaH of a tetravalent trimannoside analog is nearly four times greater than that of the corresponding monovalent analog. Increases in K(a) values of the multivalent carbohydrates relative to monovalent analogs, known as the "multivalency effect," are shown to be due to more positive entropy (TDeltaS) contributions to binding of the former sugars. A general thermodynamic model for distinguishing binding of multivalent ligands to a single receptor with multiple, equal subsites versus binding to separate receptor molecules is given.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,824

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations213
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetGlycosylation and Glycoproteins ResearchTravaux en français237 207