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Enregistrement W2140032108 · doi:10.1021/ac400161j

Platform for High-Throughput Testing of the Effect of Soluble Compounds on 3D Cell Cultures

2013· article· en· W2140032108 sur OpenAlexafffund
Frédérique Deiss, Aaron D. Mazzeo, Estrella Hong, Donald E. Ingber, Ratmir Derda, George M. Whitesides

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
Thématique3D Printing in Biomedical Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesHansjörg Wyss Institute for Biologically Inspired Engineering, Harvard UniversityUniversity of AlbertaBill and Melinda Gates FoundationFoundation for the National Institutes of HealthAlberta Glycomics CentreU.S. Department of Defense
Mots-clésChemistryCell cultureThroughputSelf-healing hydrogels3D cell cultureMicrotiter plateNanotechnologyStackingHigh-throughput screeningIn vitroBiophysicsChromatographyBiochemistryOrganic chemistryMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In vitro 3D culture could provide an important model of tissues in vivo, but assessing the effects of chemical compounds on cells in specific regions of 3D culture requires physical isolation of cells and thus currently relies mostly on delicate and low-throughput methods. This paper describes a technique ("cells-in-gels-in-paper", CiGiP) that permits rapid assembly of arrays of 3D cell cultures and convenient isolation of cells from specific regions of these cultures. The 3D cultures were generated by stacking sheets of 200-μm-thick paper, each sheet supporting 96 individual "spots" (thin circular slabs) of hydrogels containing cells, separated by hydrophobic material (wax, PDMS) impermeable to aqueous solutions, and hydrophilic and most hydrophobic solutes. A custom-made 96-well holder isolated the cell-containing zones from each other. Each well contained media to which a different compound could be added. After culture and disassembly of the holder, peeling the layers apart "sectioned" the individual 3D cultures into 200-μm-thick sections which were easy to analyze using 2D imaging (e.g., with a commercial gel scanner). This 96-well holder brings new utilities to high-throughput, cell-based screening, by combining the simplicity of CiGiP with the convenience of a microtiter plate. This work demonstrated the potential of this type of assays by examining the cytotoxic effects of phenylarsine oxide (PAO) and cyclophosphamide (CPA) on human breast cancer cells positioned at different separations from culture media in 3D cultures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil0,305

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations121
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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