Controlling proteolytic degradation of the methionine enriched MB-1Trp protein
Notice bibliographique
Résumé
Protein design is currently used for the creation of new proteins with desirable traits, which include a superior nutritional value. One of the challenges of protein design in this area is to achieve the production of stable native-like proteins that resist the proteolytic pressure of the organism used for its production (the bioreactor). We report here the identification of a specific peptide bond sensitive to E. coli proteolysis in the designer protein MB-1Trp. In an attempt to reduce proteolysis, we have created a MB-1TrpHis gene library in which the two amino acids surrounding the peptide bond, N44 and L45, were randomized using degenerated oligonucleotides. The initial characterization of MB-1TrpHis N44E/L45V and MB-1TrpHis N44E/L45M, 2 variants of the library that were more resistant than the parent protein, was performed in order to investigate the nature of the mutants' resistance. Our results suggest that the mutants behaved like MB-1Trp regarding folding and thermal stability, and that proteolytic resistance is due to the elimination of the protease recognition site.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».