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Enregistrement W2140073280 · doi:10.1093/toxsci/kfg097

Genotoxic Stress Response Gene Expression in the Mid-Organogenesis Rat Conceptus

2003· article· en· W2140073280 sur OpenAlexafffund
Robert K. Vinson

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésConceptusYolk sacBiologyGadd45OrganogenesisEmbryoDNA damageGene expressionCell biologyEmbryo cultureOxidative stressMolecular biologyAndrologyGeneEmbryogenesisGeneticsCell cycleEndocrinologyDNAFetusCell cycle checkpoint

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ability of the conceptus to respond to genotoxic stress may be critical for normal development, particularly after exposure to genotoxic teratogens. Members of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) superfamily are involved in controlling cell cycle activity and maintaining genomic stability. The expression of PI3K family members ATM, ATR, and DNA-PKcs, and downstream genes p53, GADD45, and p21, was examined in the mid organogenesis rat conceptus in vivo on gestational days (GD) 10 through 12 and in vitro following exposure to genotoxic stress. ATM was the most highly expressed PI3K family member in both yolk sac and embryo proper, with transcript levels increasing ~fourfold in the embryo from GD 10 to 12. Transcript concentrations for ATR, DNA-PKcs, and downstream genes were low in both tissues; all genes had increased transcript levels exclusively in the GD 12 embryo. Transient oxidative stress, induced by short-term, in vitro embryo culture, had no effect on transcript levels in either tissue. Culture for 24 or 44 h significantly decreased ATM transcript levels in both embryo and yolk sac, but downstream genes were unaffected compared to GD-11 and -12 in vivo levels, respectively. Exposure to 4-hydroperoxycyclophosphamide (4-OOHCPA), an activated form of the nitrogen mustard cyclophosphamide (CPA), had no effect on transcript levels for any of the genes examined. Therefore, while transcripts for genotoxic stress-response genes are present in the mid organogenesis rat conceptus, their expression is not regulated by exposure in culture to either transient oxidative stress or a genotoxic alkylating agent. The inability of the conceptus to upregulate transcripts in response to insult may contribute to an increased susceptibility to stressors during organogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,400

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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