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Enregistrement W2140119380 · doi:10.1074/jbc.m202682200

Fep1, an Iron Sensor Regulating Iron Transporter Gene Expression in Schizosaccharomyces pombe

2002· article· en· W2140119380 sur OpenAlexafffund
Benoit Pelletier, Jude Beaudoin, Yukio Mukai, Simon Labbé

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSchizosaccharomyces pombeGeneBiologyRepressorSchizosaccharomycesMutantTranscription (linguistics)Transcription factorGeneticsMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Schizosaccharomyces pombe cells acquire iron under high affinity conditions through the action of a cell surface ferric reductase encoded by the frp1(+) gene and a two-component iron-transporting complex encoded by the fip1(+) and fio1(+) genes. When cells are grown in the presence of iron, transcription of all three genes is blocked. A conserved regulatory element, 5'-(A/T)GATAA-3', located upstream of the frp1(+), fip1(+), and fio1(+) genes, is necessary for iron repression. We have cloned a novel gene, termed fep1(+), which encodes an iron-sensing transcription factor. Binding studies reveal that the putative DNA binding domain of Fep1 expressed as a fusion protein in Escherichia coli specifically interacts with the 5'-(A/T)GATAA-3' sequence in an iron-dependent manner. In a fep1 Delta mutant strain, the fio1(+) gene is highly expressed and is unregulated by iron. Furthermore, the fep1 Delta mutation increases activity of the cell surface iron reductase and renders cells hypersensitive to the iron-dependent free radical generator phleomycin. Mutations in the transcriptional co-repressors tup11(+) and tup12(+) are phenocopies to fep1(+). Indeed, strains with both tup11 Delta and tup12 Delta deletions fail to sense iron. This suggests that in the presence of iron and Fep1, the Tup11 and Tup12 proteins may act as co-repressors for down-regulation of genes encoding components of the reductive iron transport machinery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,523

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations125
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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