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Enregistrement W2140225749 · doi:10.1139/g08-058

Genetic diversity of the azuki bean (<i>Vigna angularis</i>(Willd.) Ohwi &amp; Ohashi) gene pool as assessed by SSR markers

2008· article· en· W2140225749 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenome · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAgricultural pest management studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHenan Agricultural UniversityHenan University
Mots-clésGermplasmBiologyDomesticationGenetic diversityVignaIntrogressionAlleleGenetic relationshipGene poolBotanyGenetic variationGenetic distanceHorticultureGeneticsGenePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To facilitate the wider use of genetic resources including newly collected cultivated and wild azuki bean germplasm, the genetic diversity of the azuki bean complex, based on 13 simple sequence repeat (SSR) primers, was evaluated and a core collection was developed using 616 accessions originating from 8 Asian countries. Wild germplasm from Japan was highly diverse and represented much of the allelic variation found in cultivated germplasm. The SSR results together with recent archaeobotanical evidence support the view that Japan is one center of domestication of azuki bean, at least for the northeast Asian azuki bean. Cultivated azuki beans from China, Korea, and Japan were the most diverse and were genetically distinct from each other, suggesting a long and relatively isolated history of cultivation in each country. Cultivated azuki beans from eastern Nepal and Bhutan were similar to each other and quite distinct from others. For two primers, most eastern Nepalese and Bhutanese cultivated accessions had null alleles. In addition, wild accessions from the Yangtze River region of China and the Himalayan region had a null allele for one or the other of these primers. Whether the distinct diversity of azuki bean in the Himalayan region is due to introgression or separate domestication events requires further study. In contrast, western Nepalese azuki beans showed an SSR profile similar to that of Chinese azuki beans. The genetic distinctness of cultivated azuki beans from Vietnam has been revealed for the first time. The specific alleles indicate that Vietnamese azuki beans have been cultivated in isolation from Chinese azuki beans for a long time. Wild germplasm from the Himalayan region showed the highest level of variation. Based on the results, Himalayan germplasm could be considered a novel gene source for azuki bean breeding. A comparison with mungbean SSR analysis revealed that the mean gene diversity of cultivated azuki bean (0.74) was much higher than that of cultivated mungbean (0.41). The reduction in gene diversity due to domestication, the domestication bottleneck, in azuki bean is not strong compared with that in mungbean.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,808
Score d'incertitude au seuil0,804

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle