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Enregistrement W2140280725 · doi:10.1080/17451000.2014.943241

Molecular contributions to species boundaries in dicyemid parasites from eastern Pacific cephalopods

2014· article· en· W2140280725 sur OpenAlex
Roya Eshragh, Brian S. Leander

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMarine Biology Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueParasite Biology and Host Interactions
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeEvolutionary biologyDNA barcodingPhylogenetics18S ribosomal RNALineage (genetic)CephalopodZoologyEcologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dicyemids are enigmatic parasites found within the excretory systems of benthic cephalopods. The phylogenetic position and overall diversity of dicyemids remains poorly understood, in part because current species delimitation criteria are based solely on morphological traits. Understanding the diversity of parasite species is particularly problematic because they tend to be devoid of consistent (informative) morphological traits while simultaneously rich in morphological variation associated with developmental stages and environmental conditions. In this study, we tested the boundaries of currently described morphospecies of dicyemids using molecular phylogenetic data. Variation within sequences of the small subunit (18S) rRNA gene was explored because this marker (1) is known to be fast-evolving in parasitic eukaryotes, (2) is one of the few molecular markers to have been previously sequenced in some dicyemids, and (3) has been used successfully as a DNA barcode in other groups of parasites. Three species of cephalopods were collected, each hosting several different morphospecies of dicyemid parasites. Thirty-four individual dicyemids encompassing eight different morphospecies were isolated and their 18S rDNA sequenced. Molecular phylogenetic analyses of these data were incongruent with current morphology-based species descriptions. The 18S rDNA sequences suggest that each host species of cephalopod harbors one species of dicyemid encompassing a great deal of morphological variation. The addition of DNA sequences to understanding dicyemid diversity clarifies species boundaries in a lineage that is difficult to define in nearly every aspect.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,307
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,405
Écart entre enseignants0,377 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle