Activation of paternally expressed genes and perinatal death caused by deletion of the<i>Gtl2</i>gene
Notice bibliographique
Résumé
The Dlk1-Gtl2 imprinting locus is located on mouse distal chromosome 12 and consists of multiple maternally expressed non-coding RNAs and several paternally expressed protein-coding genes. The imprinting of this locus plays a crucial role in embryonic development and postnatal growth. At least one cis-element, the intergenic differentially methylated region (IG-DMR) is required for expression of maternally expressed genes and repression of silenced paternally expressed genes. The mechanism by which the IG-DMR functions is largely unknown. However, it has been suggested that the unmethylated IG-DMR acts as a positive regulator activating expression of non-coding RNAs. Gtl2 is the first non-coding RNA gene downstream of the IG-DMR. Although its in vivo function in the mouse is largely unknown, its human ortholog MEG3 has been linked to tumor suppression in human tumor-derived cell lines. We generated a knockout mouse model, in which the first five exons and adjacent promoter region of the Gtl2 gene were deleted. Maternal deletion of Gtl2 resulted in perinatal death and skeletal muscle defects, indicating that Gtl2 plays an important role in embryonic development. The maternal deletion also completely abolished expression of downstream maternally expressed genes, activated expression of silenced paternally expressed genes and resulted in methylation of the IG-DMR. By contrast, the paternal inherited deletion did not have this effect. These data strongly indicate that activation of Gtl2 and its downstream maternal genes play an essential role in regulating Dlk1-Gtl2 imprinting, possibly by maintaining active status of the IG-DMR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».