A high-resolution MACROscope with differential phase contrast, transmitted light, confocal fluorescence, and hyperspectral capabilities for large-area tissue imaging
Notice bibliographique
Résumé
Recent advances in imaging technology have contributed greatly to biological science. Confocal fluorescence microscopes can acquire two-dimensional and three-dimensional images of biological samples such as live or fixed cells and tissues. Specimens that are large (e.g., a 10 mm/spl times/10 mm tissue section) and overfill the field of view (FOV) of typical microscope objectives require the use of image tiling to cover the entire specimen. This can be time consuming and cause artifacts in the composite image. The MACROscope system (Biomedical Photometrics Inc., Waterloo, ON, Canada) is a confocal device with a 22 mm/spl times/70 mm FOV designed for imaging large tissue sections in a single frame. The prototype demonstrated here can obtain images in reflected, transmitted, fluorescence, phase contrast, and hyperspectral modes. The new spectral imaging mode is characterized with a series of test targets, and sampled spectra are compared to a commercial spectrometer. Fluorescence images of human SiHa tumor xenografts stained with CD31-Cy3, showing blood vessel location, and EF5-Cy5, showing areas of tissue hypoxia, were collected. Differential phase contrast images of the same section, as well as human epithelial cells, were recorded to assess the phase contrast mode. Additionally, fluorescence images of Cytokeratin-Cy3 stained squamous cell carcinoma tissue sections were captured. Finally, red, green, blue transmitted light images of human tongue were obtained. This new device avoids the need for image tiling and provides simultaneous imaging of multiple fluorescently labeled tissue-specific markers in large biological samples. This enables time- and cost-efficient imaging of (immuno)histopathological samples. This device may also serve in the imaging of high-throughput DNA and tissue arrays.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».