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Enregistrement W2140293999 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-14-0861

PLEKHA5 as a Biomarker and Potential Mediator of Melanoma Brain Metastasis

2014· article· en· W2140293999 sur OpenAlexaff
Lucia B. Jilaveanu, Fabio Parisi, Meaghan L. Barr, Christopher R. Zito, William Cruz‐Muñoz, Robert S. Kerbel, David L. Rimm, Marcus Bosenberg, Ruth Halaban, Yuval Kluger, Harriet M. Kluger

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBrain Metastases and Treatment
Établissements canadiensSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Research ResourcesNational Cancer Institute
Mots-clésBrain metastasisMelanomaGene knockdownMetastasisCancer researchImmunofluorescenceCell culturePathologyBiologyTissue microarrayMedicineGene expression profilingViability assayGene expressionCancerImmunologyImmunohistochemistryInternal medicineGeneAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Approximately 40% of patients with metastatic melanoma develop brain metastases. Our purpose was to identify genes aberrantly expressed in melanoma that might be associated with propensity for brain homing. EXPERIMENTAL DESIGN: We studied gene expression profiles in a cell line model of brain metastasis (cerebrotropic A375Br cells vs. parental A375P cells) and compared them with profiles of patients who developed early brain metastases and who did not. A tissue microarray containing 169 metastatic melanoma cases with variable time to brain metastasis was constructed to further study marker expression by quantitative immunofluorescence. An in vitro model of the blood brain barrier (BBB) was generated to evaluate potential mediators of brain metastases. RESULTS: PLEKHA5 was differentially expressed in both the A375 cell line model and patient samples subjected to gene expression profiling. At the protein level, by quantitative immunofluorescence, PLEKHA5 was associated with decreased brain metastasis-free survival. PLEKHA5 overexpression was not associated with other metastatic sites. Knockdown of PLEKHA5 decreases the viability of A375Br cells, inhibits BBB transmigration and invasion in vitro. Similar results were found with YUMUL cells, cultured from a patient with overwhelming brain metastases. PLEKHA5 knockdown did not affect the viability of A375P cells. CONCLUSIONS: PLEKHA5 expression in melanoma tumors was associated with early development of brain metastases. Inhibition of PLEKHA5 might decrease passage across the BBB and decrease proliferation and survival of melanoma cells both in the brain and in extracerebral sites.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,194
Tête enseignante GPT0,534
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations92
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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