Coupled Arsenotrophy in a Hot Spring Photosynthetic Biofilm at Mono Lake, California
Notice bibliographique
Résumé
Red-pigmented biofilms grow on rock and cobble surfaces present in anoxic hot springs located on Paoha Island in Mono Lake. The bacterial community was dominated ( approximately 85% of 16S rRNA gene clones) by sequences from the photosynthetic Ectothiorhodospira genus. Scraped biofilm materials incubated under anoxic conditions rapidly oxidized As(III) to As(V) in the light via anoxygenic photosynthesis but could also readily reduce As(V) to As(III) in the dark at comparable rates. Back-labeling experiments with (73)As(V) demonstrated that reduction to (73)As(III) also occurred in the light, thereby illustrating the cooccurrence of these two anaerobic processes as an example of closely coupled arsenotrophy. Oxic biofilms also oxidized As(III) to As(V). Biofilms incubated with [(14)C]acetate oxidized the radiolabel to (14)CO(2) in the light but not the dark, indicating a capacity for photoheterotrophy but not chemoheterotrophy. Anoxic, dark-incubated samples demonstrated As(V) reduction linked to additions of hydrogen or sulfide but not acetate. Chemoautotrophy linked to As(V) as measured by dark fixation of [(14)C]bicarbonate into cell material was stimulated by either H(2) or HS(-). Functional genes for the arsenate respiratory reductase (arrA) and arsenic resistance (arsB) were detected in sequenced amplicons of extracted DNA, with about half of the arrA sequences closely related ( approximately 98% translated amino acid identity) to those from the family Ectothiorhodospiraceae. Surprisingly, no authentic PCR products for arsenite oxidase (aoxB) were obtained, despite observing aerobic arsenite oxidation activity. Collectively, these results demonstrate close linkages of these arsenic redox processes occurring within these biofilms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».