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Enregistrement W2140345942 · doi:10.1152/ajpregu.00192.2008

Regulation of pyruvate dehydrogenase in the common killifish,<i>Fundulus heteroclitus</i>, during hypoxia exposure.

2008· article· en· W2140345942 sur OpenAlexaff
Jeffrey G. Richards, Brian A. Sardella, Patricia M. Schulte

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Regulatory, Integrative and Comparative Physiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFundulusKillifishPyruvate dehydrogenase complexLactate dehydrogenasePyruvate dehydrogenase kinaseHypoxia (environmental)BiologyBiochemistryGlycolysisCitric acid cycleMitochondrionPyruvate dehydrogenase phosphataseInternal medicineEndocrinologyMetabolismChemistryEnzymeOxygen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We examined the metabolic responses of the hypoxia-tolerant killifish (Fundulus heteroclitus) to 15 h of severe hypoxia and recovery with emphasis on muscle substrate usage and the regulation of the mitochondrial protein pyruvate dehydrogenase (PDH), which controls carbohydrate oxidation. Hypoxia survival involved a transient activation of substrate-level phosphorylation in muscle (decreases in [creatine phospate] and increases in [lactate]) during which time mechanisms to reduce overall ATP consumption were initiated. This metabolic transition did not affect total cellular [ATP], but had an impact on cellular energy status as indicated by large decreases in [ATP]/[ADP(free)] and [ATP]/[AMP(free)] and a significant loss of phosphorylation potential and Gibbs free energy of ATP hydrolysis (DeltafG'). The activity of PDH was rapidly (within 3 h) decreased by approximately 50% upon hypoxia exposure and remained depressed relative to normoxic samples throughout. Inactivation of PDH was primarily mediated via posttranslational modification following the accumulation of acetyl-CoA and subsequent activation of pyruvate dehydrogenase kinase (PDK). Estimated changes in cytoplasmic and mitochondrial [NAD(+)]/[NADH] did not parallel one another, suggesting the mitochondrial NADH shuttles do not function during hypoxia exposure. Large increases in the expression of PDK (PDK isoform 2) were consistent with decreased PDH activity; however, these changes in mRNA were not associated with changes in total PDK-2 protein content assessed using mammalian antibodies. No other changes in the expression of other known hypoxia-responsive genes (e.g., lactate dehydrogenase-A or -B) were observed in either muscle or liver.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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