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Enregistrement W2140486908 · doi:10.2174/1381612043382503

Lymnaea EGF and Gigantoxin I, Novel Invertebrate Members of the Epidermal Growth Factor Family

2004· review· en· W2140486908 sur OpenAlexaff
Patrice Hermann, Catherine H. Schein, Gregg T. Nagle, Willem C. Wildering

Notice bibliographique

RevueCurrent Pharmaceutical Design · 2004
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpidermal growth factorBiologyReceptorPeptide sequenceCell biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this review, we compare the sequence and structural relationships of two epidermal growth factor (EGF) family related proteins that have recently been discovered in invertebrate species. The first is L-EGF, a secreted growth factor from the gastropod mollusk Lymnaea stagnalis. The second is a peptide toxin (Gigantoxin I), isolated from the sea anenome Stichodactyla giganteus, which can paralyze crabs. L-EGF and Gigantoxin I share striking sequence similarity with mammalian erbB1 receptor ligands, including most of the essential receptor binding sites. Intriguingly, L-EGF's tertiary structure resembles more the structure of the EGF-like domain of coagulation factors. That is, the secondary and tertiary structure of L-EGF indicates the presence of a double-stranded beta-sheet but also suggests that this protein, in contrast to all other erbB1 ligands, contains a calcium-binding domain. One of the most remarkable features of L-EGF and Gigantoxin I however, is the indication that these protein are synthesized as non-membrane bound secreted peptides. This feature sets L-EGF and Gigantoxin I apart from all other members of the EGF family or EGF-like proteins identified thus far. We discuss sequence similarities and dissimilarities in the light of indications that, despite the more than 600 million years of phylogenetic distance separating both these invertebrates from mammals, Gigantoxin I and L-EGF retain some affinity for the mammalian erbB-family of receptors. Considering that mammalian EGF and its family members are frequently implicated in neoplastic diseases, the increasing number of identified and characterized invertebrate EGF family members may provide valuable leads in the design of erbB receptor antagonists.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,916
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,131
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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