Lymnaea EGF and Gigantoxin I, Novel Invertebrate Members of the Epidermal Growth Factor Family
Notice bibliographique
Résumé
In this review, we compare the sequence and structural relationships of two epidermal growth factor (EGF) family related proteins that have recently been discovered in invertebrate species. The first is L-EGF, a secreted growth factor from the gastropod mollusk Lymnaea stagnalis. The second is a peptide toxin (Gigantoxin I), isolated from the sea anenome Stichodactyla giganteus, which can paralyze crabs. L-EGF and Gigantoxin I share striking sequence similarity with mammalian erbB1 receptor ligands, including most of the essential receptor binding sites. Intriguingly, L-EGF's tertiary structure resembles more the structure of the EGF-like domain of coagulation factors. That is, the secondary and tertiary structure of L-EGF indicates the presence of a double-stranded beta-sheet but also suggests that this protein, in contrast to all other erbB1 ligands, contains a calcium-binding domain. One of the most remarkable features of L-EGF and Gigantoxin I however, is the indication that these protein are synthesized as non-membrane bound secreted peptides. This feature sets L-EGF and Gigantoxin I apart from all other members of the EGF family or EGF-like proteins identified thus far. We discuss sequence similarities and dissimilarities in the light of indications that, despite the more than 600 million years of phylogenetic distance separating both these invertebrates from mammals, Gigantoxin I and L-EGF retain some affinity for the mammalian erbB-family of receptors. Considering that mammalian EGF and its family members are frequently implicated in neoplastic diseases, the increasing number of identified and characterized invertebrate EGF family members may provide valuable leads in the design of erbB receptor antagonists.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».