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Enregistrement W2140620500 · doi:10.1128/jvi.01702-13

Role of Herpes Simplex Virus VP11/12 Tyrosine-Based Motifs in Binding and Activation of the Src Family Kinase Lck and Recruitment of p85, Grb2, and Shc

2013· article· en· W2140620500 sur OpenAlexafffund
Ulrike Strunk, Holly A. Saffran, Frederick W. Wu, James R. Smiley

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research Chairs
Mots-clésGRB2BiologyPhosphorylationProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcTyrosine phosphorylationSrc family kinaseTyrosineCell biologySH2 domainKinaseSignal transductionTyrosine kinaseProtein kinase BSH3 domainBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have shown that the abundant herpes simplex virus 1 (HSV-1) tegument protein VP11/12, encoded by gene UL46, stimulates phosphatidylinositol 3-kinase (PI3-kinase)/Akt signaling: it binds the Src family kinase (SFK) Lck, is tyrosine phosphorylated, recruits the p85 subunit of PI3-kinase, and is essential for the activation of Akt during HSV-1 infection. The C-terminal region of VP11/12 contains tyrosine-based motifs predicted to bind the SH2 domains of SFKs (YETV and YEEI), p85 (YTHM), and Grb2 (YENV) and the phosphotyrosine-binding (PTB) domain of Shc (NPLY). We inactivated each of these motifs in the context of the intact viral genome and examined effects on binding and activation of Lck and recruitment of p85, Grb2, and Shc. Inactivating the p85, Grb2, or Shc motif reduced (p85) or eliminated (Grb2 and Shc) the interaction with the cognate signaling molecule without greatly affecting the other interactions or activation of Lck. Inactivating either SFK motif had only a minor effect on Lck binding and little or no effect on recruitment of p85, Grb2, or Shc. In contrast, inactivation of both SFK motifs severely reduced Lck binding and activation and tyrosine phosphorylation of VP11/12 and reduced (p85) or eliminated (Grb2 and Shc) binding of other signaling proteins. Overall, these data demonstrate the key redundant roles of the VP11/12 SFK-binding motifs in the recruitment and activation of SFKs and indicate that activated SFKs then lead (directly or indirectly) to phosphorylation of the additional motifs involved in recruiting p85, Grb2, and Shc. Thus, VP11/12 appears to mimic an activated growth factor receptor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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