Novel deletions of 14q11.2 associated with developmental delay, cognitive impairment and similar minor anomalies in three children
Notice bibliographique
Résumé
METHODS AND RESULTS: We identified de novo submicroscopic chromosome 14q11.2 deletions in two children with idiopathic developmental delay and cognitive impairment. Vancouver patient 5566 has a approximately 200 kb deletion and Vancouver patient 8326 has a approximately 1.6 Mb deletion. The Database of Chromosomal Imbalance and Phenotype in Humans using Ensembl Resources (DECIPHER) revealed a third patient with idiopathic developmental delay and cognitive impairment, DECIPHER patient 126, who has a approximately 1.1 Mb deletion of 14q11.2. The deletion of patient 5566 overlaps that of patient 126 and both of these deletions lie entirely within that of patient 8326. All three children have similar dysmorphic features, including widely-spaced eyes, short nose with flat nasal bridge, long philtrum, prominent Cupid's bow of the upper lip, full lower lip and similar auricular anomalies. CONCLUSION: The minimal common deletion region on chromosome 14q11.2 is only approximately 35 kb (from 20.897 to 20.932, University of California at Santa Cruz (UCSC) Genome Browser; build hg18, March 2006) and includes only two genes, SUPT16H and CHD8, which are good candidate genes for the phenotypes. The non-recurrent breakpoints of these patients, the presence of normal copy number variants in the region and the local genomic structure support the notion that this region has reduced stability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».