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Enregistrement W2140641884 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-09-1476

Vascular Endothelial Growth Factor Concentration as a Predictive Marker: Ready for Primetime?

2010· letter· en· W2140641884 sur OpenAlexaff
Peter A. Kavsak, Hal W. Hirte, Sebastién J. Hotte

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2010
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClinical Laboratory Practices and Quality Control
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVascular endothelial growth factorMedicineGrowth factorInternal medicineVEGF receptorsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To the Editors: The article by Hanrahan et al. in the May issue of Clinical Cancer Research (1) describes the clinical utility of baseline vascular endothelial growth factor (VEGF) to identify subjects who may benefit from treatment with vandetanib (a VEGF receptor/epidermal growth factor receptor/RET inhibitor; ref. 1). However, important issues, such as preanalytic, analytic, and postanalytic interpretation for VEGF concentrations, need to be addressed before a VEGF cutoff can be “applied to clinical practice” as the authors conclude. First, an important preanalytic issue is the choice of sample type (e.g., matrix). Hanrahan and colleagues indicate that sample type (serum versus EDTA plasma) is a major factor in the concentrations observed, which cannot be easily extrapolated when considering reference intervals and cutoffs. For example, despite using the matrix-specific cutoffs in their study groups (e.g., study groups 3, 6, and 7), only the low VEGF group in study groups 3 and 6 (both with EDTA plasma) had significant lower hazard ratios ( P Second, the analytic performance of the VEGF assay was not reported; only the limit of detection and analytic range were stated. Without knowledge of the precision across the analytic range, it cannot be assumed that adequate performance was obtained at the different cutoffs used in the study. Third, the cutoffs chosen are likely inappropriate. The population where the cutoffs are derived is not characterized (e.g., sex, age, and biochemical indices not provided) and the sample size is too small ( n = 37; ref. 1). Minimally, 120 healthy individuals are required to establish a reference interval, and more if subgrouping is required (3). This type of reference interval study has previously been done for VEGF in EDTA plasma ( n = 304 children; n = 540 adults), which showed that VEGF concentrations are age dependent, with positive associations existing with platelet count, alanine aminotransferase, and oral contraceptive use (4). Unfortunately, Hanrahan et al. (1) did not include these important covariates in their models. We believe that future prospective studies assessing VEGF measurement should incorporate these important preanalytic, analytic, and postanalytic issues. Disclosure of Potential Conflicts of Interest P. Kavsak, commercial research grant and honoraria, Beckman Coulter; commercial research support, Randox Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,065
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,077

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,065
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0070,005
Science ouverte0,0060,001
Intégrité de la recherche0,0130,024
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,287
Tête enseignante GPT0,555
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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