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Enregistrement W2140663455 · doi:10.1139/f10-034

The influence of Wisconsinan glaciation and contemporary stream hydrology on microsatellite DNA variation in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

2010· article· en· W2140663455 sur OpenAlexaffvenueabout
Patrick Tamkee, Eric A. Parkinson, Eric B. Taylor

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensMinistry of EnvironmentUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRainbow troutBiological dispersalTroutEcologyGenetic diversityGenetic variationIsolation by distanceGlacial periodFluvialBiologyMicrosatellitePopulationGenetic structureGeographyFisheryFish <Actinopterygii>Structural basinPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microsatellite DNA variation was examined in rainbow trout ( Oncorhynchus mykiss ) populations from throughout British Columbia, Canada, to address the roles of historical isolation, postglacial dispersal, and contemporary geomorphology in structuring genetic variation and differentiation. We detected signatures of historical isolation and postglacial recolonization in the form of “interior” and “coastal” population groupings, a decline in genetic variation as distance increased from putative glacial refugia, and different extents of isolation-by-distance in different regions. Rainbow trout populations were structured genetically into major regions and into smaller watersheds and then into drainages. Within drainages, high levels of dispersal and gene flow were inferred between geographically proximate and contiguous lakes. Elevation, stream branching points (nodes), fluvial distance, migration barriers, and stream and lake order influenced genetic diversity within, and differentiation among, populations. Habitat characteristics, particularly lake surface area and perimeter, were poor predictors of genetic variation. Although founder events and postglacial dispersal influenced broadscale patterns of genetic diversity in rainbow trout, our results suggest that contemporary factors can strongly modulate historical patterns.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,867
Score d'incertitude au seuil0,265

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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